Die optimale Filterung des Dachwassers ist die entscheidende Voraussetzung für die Wasserqualität im Tank. Hier kommen spezielle Filtersysteme zum Einsatz, die mit Durchlassweiten von 0,2 mm bis 1,0 mm das von den Dachflächen ablaufende Wasser von groben Verunreinigungen befreien und auch kleinere Partikel ausfiltern. Empfohlen wird, das die bei der Entwässerung am Gebäude nach DIN 1986 zugrunde gelegte maximale Menge von 300 l/s und Hektar den Filter rückstaufrei passieren kann. Dabei muss der Leitungsquerschnitt des Filterzulaufs durchgängig gewährleistet sein. Der Filter sollte einfach zu reinigen und wartungsarm sein. Verschiedene Filtersysteme, je nach Einsatz und Konzeption des Gesamtsystems, stehen hier zur Auswahl.